航母作为核心战略单位，其使用需要特别注意保护措施和战术配置。航母集中了舰队大部分伤害输出能力，但资产需求高且制造时间长，一旦损毁会严重影响战斗力和发展进度。首要任务是优先升级航母的血量、护甲、闪避和拦截系统，这些基础属性的提升能显著增强生存能力。同时建议将航母编入主队时搭配战列巡洋舰作为前排抗伤单位，并在战巡损失过半时及时撤退以避免航母暴露在火力下。舰队中还应配置拦截型舰船防止敌方侧翼突袭，光锥级巡洋舰是不错的防空选择。
航母的战术部署需要结合指挥值系统进行合理规划。由于每艘大型舰船消耗指挥值较高，过度依赖航母会导致舰队小船数量不足，容易陷入被护卫舰群围攻的困境。建议将航母设置为独立编队，避免与其他主力舰混编导致战斗力分散。在群战时采用封锁战术形成夹击态势，而非让航母单独突进。劣势局中应提前规划航母撤离路线，优先选择曲率飞行时间长的航线或小行星带等复杂地形区域。优势局也需注意不让航母在外过夜，防止被敌方偷袭。
目前主流配置分为战斗机型和护航艇型两种路线，前者爆发力强但需要频繁返回补给，后者可持续作战但单体伤害较低。技术值加点应根据载机类型有所侧重，战斗机优先提升返回冷却速度，护航艇则侧重伤害和命中率。需要注意的是载机伤害加点的性价比相对较低，每点技术值仅能提升约3%的伤害值。特殊模块如B1附加舰载机系统能额外增加载机数量，若获得应优先装备。
必须建立完善的预警机制。保持基地主舰队随时处于编队状态，防止被突袭时航母被迫分散应战。当基地遭受连续攻击且护盾即将耗尽时，应果断选择拆除航母保留资源，避免被敌方缴获。采矿作业时建议将航母停靠在安全区域，远离资源争夺热点。与同盟成员共享矿区信息，建立联合防御体系，能有效降低航母遭遇突袭的风险。
战略打击是航母的特殊战术功能，但使用时需注意多个要点。该功能需要多人协同开启才能发挥最大效果，单艘航母的战略打击效果有限。执行轰炸时舰队将无法移动，必须提前部署防空舰船提供保护。推荐携带T800、林枭等独立作战的舰载机执行此类任务。攻击序列的设置也至关重要，合理的序列能显著提升打击效率。战略打击并非绝对优势战术，需要根据战场形势谨慎选择使用时机。
战后应及时返回基地进行维修，避免带伤作战。资源储备应保持充足，确保受损后能快速重建。定期检查各系统模块的运行状态，特别是载机起降系统的完好程度。与同盟保持密切沟通，及时获取战场情报，能帮助预判风险并调整航母部署。这些细节管理虽看似琐碎，却是保证航母持续作战能力的关键。
